DIAMOND análisis de DAA lleva días sin completarse

[iKassadin]

Hola,

Tengo un problema grave con un análisis DIAMOND en usegalaxy.eu que ha estado corriendo sin completarse durante varios días. Los detalles son:

Información del Análisis:

• Historial: SRR35949146 (Diamond on collection 1: DAA)
• Datasets: 2 (forward y reverse)
• Estado: Currently running (amarillo)
• Tiempo de ejecución: Más de varios días

Problema:
El análisis de DIAMOND no está completando su ejecución. Está en estado de ejecución pero aparentemente se ha estancado. Necesito ayuda para:

1. Entender por qué el análisis tarda tanto tiempo
2. Si es un problema de recursos del servidor
3. Si es un problema con los parámetros de la herramienta
4. Posibles soluciones

Este es un proyecto de metagenómica importante para mi trabajo y necesito resolver esto cuanto antes. Cualquier información sobre el estado del servidor o el comportamiento de la herramienta sería muy útil.

Gracias por la ayuda.

[jennaj]

Hello @iKassadin

Your jobs appear to be queued! This is normal and expected. Be sure to leave your work queued so it can complete processing.

Many more details can be found here → queued-gray-datasets

With a summary here

@jennaj

When working at UseGalaxy.org, UseGalaxy.eu, or UseGalaxy.org.au, your analysis jobs execute at large scale academic clusters. Hundreds of thousands of jobs process each month!

• Use a Workflow for batch work.
• Allow queued (grey color) and executing (yellow-orange) datasets to finish processing.
• Deleting and rerunning puts your job back at the end of the queue again!
• Job priority is the exactly the same for everyone.
• Be patient. Galaxy is a free service, when a lot of people are using it, you may have to wait longer than usual (especially for ‘big’ jobs, e.g. alignments).

Hope this helps to understand how jobs process!